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下一代测序(NGS),中国市场对新技术具有极大包容性——访安捷伦副总裁兼生物分子分析事业部总经理Kevin Corcor
i实验室 / 2020-04-14

我们正在迈进一个人类健康科技蓬勃发展的大好时代,新技术的诞生掀起了精准医疗的革命。下一代测序(NGS)技术使科学家能够快速、低成本地对整个基因组进行“测序”,使医生能够更早、更有效且以更低的成本发现和治疗疾病。在测序领域,大众常把目光放在测序仪上,其实测序前的质控工作同样至关重要。

  安捷伦自1999年推出第一台基因样本质控设备,多年来不断完善产品性能,拓展应用场景,丰富产品线。目前,安捷伦在测序质控市场占有量很大,业务开展得非常成功。无论是从客户资源、市场拓展还是产品技术,安捷伦在测序质控市场的优势地位毋庸置疑。

  为了解全球测序产业前景及安捷伦对于NGS领域的布局和市场策略,仪器信息网特别专访了安捷伦副总裁兼生物分子分析事业部总经理Kevin Corcoran先生。

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Kevin Corcoran

安捷伦副总裁/生物分子分析事业部总经理

  安捷伦生物分子分析事业部(biomolecular analysis division,B.A.D),隶属于安捷伦诊断和基因组学事业部(diagnostics and genomics division,DGG),主要负责安捷伦二代测序全流程设备的研发和生产。

  全球NGS产业周期性放缓 中国市场潜力巨大

  人们习惯将测序技术区分为一代、二代或者三代测序技术。事实上,除了一代经典的Sanger测序技术,二代和三代仅是测序原理不同,而非代际关系。尽管三代测序技术已经出现,但短读长的二代测序仍是主流。且由于二代测序和三代测序技术具有互补性,这两类技术将在一定时期内长期共存。

  前几年,基因测序技术在中国掀起投资狂潮,行业年平均增速达15%~18%。近期,二代测序市场增速放缓到11%左右,Kevin表示这与全球经济形势的变化有关。“和其他行业一样,基因测序行业的发展总会出现周期性的波动。”

  的确,对于任何新技术来说,前期一定会出现高速增长,一旦到达某一阶段,增速会放缓,基因测序也不例外。已在基因测序行业从业31年的Kevin表示:“从宏观看来,基因测序市场增长放缓只是暂时现象,未来,该领域一定会出现回升,最终会回到高速增长的状态。”

  据Kevin介绍,北美基因测序市场已经非常成熟,北美地区的医院已经开始大量使用基因测序仪,医院对质控设备需求很大。“北美和欧洲是安捷伦BAD最大的市场,但市场增速在放缓。”

  Kevin曾在PacBio担任重要职位,他带领的PacBio在中国市场战绩辉煌。根据据Kevin的市场经验,虽然中国在基因测序领域仍处于起步阶段,但其已然成为增长潜力最大的地区。“所以,在2020年,安捷伦会把目标聚焦在具有强大潜力的中国市场。”

  全自动化Magnis BR是病理科利器

  据Kevin对中国市场的了解,“中国市场对新技术具有极大的包容性,对新技术的吸收能力非常强。”“在中国,一旦一项新技术开始应用,它接下来的发展将会非常迅速。”

  上个月,安捷伦在第九届中国病理年会上隆重推出了又一个让人惊艳的创新产品——NGS全自动文库制备系统Magnis BR。

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Magnis BR二代测序文库制备系统

  Magnis BR是安捷伦燃石医学强强联合,共同打造的全自动化的NGS文库制备系统,也是安捷伦面向临床病理学市场主推的产品。Magnis BR解决了二代测序前端大量的样本制备和文库构建环节的人工操作,能够将1天的人工前处理工作缩短至9个小时,且过程全自动化,操作简单。

  随着靶向药物的推出,很多优质的医院都会逐渐开展二代测序检测。而NGS是一项技术含量高、操作复杂的技术,需要实验人员较高的素养,而病理科真正能够操作NGS的人员并不多。Magnis BR 解决了这一用户痛点。“只需按一下按钮,就可以完成测序,大大减轻实验人员的负担。技术人员可以在一天内完成培训并上岗。”

  此外,对于晚期癌症病人来说,时间显得异常宝贵。能否在短时间内拿到准确的检测报告对于病理科医生来说是一个至关重要的考量因素。“通常,一个样本的测序工作流程需要一到两周时间才能出结果,而利用Magnis BR可以在三天内完成。”

  DNA文库制备工作一直是NGS工作流程中最复杂、变数最大的步骤之一。从长远来看,临床诊断是NGS文库制备系统最重要的市场。构建NGS工作流程的临床应用,是安捷伦在二代测序领域的重要战略布局。

  BAD产品线丰富 涵盖几乎所有细分

  近几年,安捷伦通过收购、整合其他的公司的产品,不断扩充、完善产品线,覆盖基因测序几乎所有细分领域的用户。除了上文介绍到的Magnis BR二代测序文库制备系统,B.A.D部门还有生物分析仪、TapeStation系统、片段分析等几个重要仪器产品。

  2100生物分析仪。2100生物分析仪能进行DNA、RNA和蛋白质量控制和定量分析,其RNA完整值是行业内目前公认的RNA完整性的金标准。“该设备以微流控芯片技术为核心,可用于电泳分离,同时对每一个片段的大小进行精确测定和浓度定量,还能进行细胞荧光参数的流式分析,分辨率很高。”该设备于1999年上市,目前,全球装机量已接近10000台。

  TapeStation系列。该系列当前有两种型号产品——4200和4150。4150 TapeStation系统于2018底年上市,是用于DNA和RNA样品质量控制的自动化解决方案。该系统一大特点是全自动化、灵活量和cfDNA的质控应用。此外,TapeStation推出了DNA完整性参数,是目前很多客户评估DNA完整性的参考标准。

  片段分析产品线。2018年初,安捷伦以2.5亿美元收购以高通量平行毛细管电泳而闻名的AATI公司,获得高分辨率毛细管电泳解决方案,从此获得能够满足高、甚至超高通量毛细管应用的能力。该产品线不仅是针对毛细管电泳,还可以解决二代测序、三代测序中的样本质控问题。

3 Kevin Corcoran展示2100生物分析仪(右)和4150 TapeStation(左)系统芯片.jpg

Kevin Corcoran 展示2100 生物分析仪(右)和4150 TapeStation(左)系统芯片

  “我们计划开发出这样一个整合基因测序解决方案,这个方案包括样本质控、Magnis BR自动化建库、测序仪、生物信息分析软件等,涵盖整个基因测序工作流程,为临床肿瘤学研究提供整体解决方案。”Kevin向我们透露,预计2021年后,安捷伦会推出一款可以整合安捷伦现有产品线的二代基因测序仪。


  受访人介绍:

  Kevin Corcoran现任安捷伦副总裁及生物分子分析事业部(B.A.D)总经理,该部门负责为下一代测序(NGS)工作流程和其他应用研究并提供解决方案。生物分子分析事业部负责所有遗传分析仪器和耗材相关的研发应用,也负责安捷伦诊断与基因组集团(Diagnostics and Genomics Group)基于NGS的集成临床工作流程解决方案项目。

  Kevin在生命科学领域拥有超过30年的经验。在加入安捷伦之前,他曾任太平洋生物科学公司(PacBio)市场开发高级副总裁。在PacBio工作的11年里,Kevin担任了重要的领导职务,并推动了两个PacBio SMRT测序平台的研发和商业发布取得成功。Kevin还曾担任美国应用生物系统公司的副总裁兼总经理,以及加盟美国林克斯(Lynx Therapeutics)公司的首席执行官。

  Kevin持有加州州立大学东湾分校的计算机科学学士学位。他和妻子Janet住在加州利弗莫尔的葡萄园中,他们喜欢骑双人自行车和打高尔夫球。此外,Kevin还是一个狂热的摩托车爱好者,在圣克拉拉经常可以看到他开着一辆宝马摩托车。


来源:仪器信息网